不良反应与卡那霉素进近似，用量小时反应较轻.如用量大，疗程长，可有白细胞减少，听力及肾损害.个别病例口周，面部和四肢皮肤发麻，眩晕，耳鸣.偶有过敏性休克.可致罗姆伯格氏症(闭目难立，暗处和洗脸时站不稳）中毒症状.大剂量使用可有尿闭，急性肾衰及神经系统症状.吸入可有过敏反应，哮喘.滴眼可有水肿，中毒性结膜炎，过敏反应. 该品的毒性较庆大霉素和卡那霉素轻，不良反应发生率约2%～3%。临床应用后少数患者可出现血尿素氮及转氨酶轻度增高，偶有耳鸣、听力暂时减退、蛋白尿、血尿、发热、头痛、麻木、食欲减退、腹泻、皮疹等。肌注处疼痛较多，但一般可以忍受。