可培氟沙星引起胃肠道刺激或不适，烧心，恶心，呕吐，食欲不振。有轻度神经系统反应。眩晕，思睡，头痛，震颤，不安。停药后症状消失（恢复正常）。
过敏反应：皮疹，搔痒，心悸，胸闷，颜面或皮肤潮红，结膜充血。可引起肝损害，停药后症状消失（恢复正常）。可引起肾损害，尿素氮升高，也可有白细胞及血小板减少，嗜酸性粒细胞增多。有引关节和肌肉痛的报道。参见诺氟沙星。
由培氟沙星所致的消化道反应较诺氟沙星、氧氟沙星和依诺沙星为多见，光感性皮炎亦较多见，约占皮疹发生者的半数。诺氟沙星的不良反应主要有：
1、恶心、呕吐、上腹不适、腹泻、纳减等消化道反应。
2、头晕、头痛、情绪不安、失眠等神经系统反应，此类反应的发生率低于消化道反应。
3、皮疹、皮肤瘙痒、血管神经性水肿、光感皮炎等过敏反应，偶可发生过敏性休克。
4、少数患者可发生肌肉疼痛、无力、关节肿痛、心悸等。
5、实验室检查可发生一过性白细胞减少，血清转氨酶、血尿素氮和肌酐等的轻度增高，亦为可逆性。
上述不良反应多轻微，大多患者可耐受。然而诺氟沙星等氟喹诺酮类偶可致严重不良反应，包括：
1、神志改变、袖搐、癫痫样发作。
2、短暂性幻觉、幻视、复视等。
3、结晶尿，发生于大剂量用药时。