氟哌啶醇片治疗的患者中，已发生猝死、QT延长和尖端扭转型室性心动过速的病例报告。服用高于推荐剂量的氟哌啶醇，会使QT延长和尖端扭转型室性心动过速的风险增加。即使在没有诱发因素的情况下亦有病例报告，建议在治疗其他QT延长病症（包括电解质紊乱[特别是低钾血症和低镁血症]，服用已知可延长QT的药物，潜在的心率异常，甲状腺功能减退和家族性长QT综合征）时，应特别谨慎。
与其他精神安定药一样，氟哌啶醇有可能引起罕见的QT间期延长。因此，氟哌啶醇片禁用于临床显著心脏疾病患者，如近期发生的急性心肌梗死、失代偿性心力衰竭、使用IA类和III类抗心律失常药物治疗的心律失常、QTc间期延长、室性心律失常或尖端扭转型室性心动过速病史、临床显著心动过缓、二度或三度心脏传导阻滞和未校正的低钾血症。氟哌啶醇片不应与其他延长QT间期的药物合并使用。
在一些非典型抗精神病药物治疗痴呆人群的随机安慰剂对照临床试验中，观察到脑血管不良事件的风险增加约3倍。这种风险增加的机制尚不清楚。对于其他抗精神病药物或其他患者人群，不能排除风险增加。有卒中危险因素的患者应慎用氟哌啶醇。
建议在肌内给药前进行基线ECG检查。治疗期间，必须评估所有患者是否需要对QT间期延长和室性心律失常进行ECG监测。
治疗期间，如果QT间期延长，建议氟哌啶醇片减量，但如果QT间期超过500ms，则必须停用氟哌啶醇片。