1、口服给药时较常见胃肠道反应，如恶心、呕吐、腹胀、腹泻、食欲不振等。
2、大剂量使用氟氯西林可出现神经系统反应，如抽搐、痉挛、神志不清、头痛等。
3、大剂量使用氟氯西林偶见中性粒细胞减少，对特异体质者可致出血倾向。
4、少数患者用药后可致急性胆汁淤积和氨基转移酶升高。
5、用药后可见药疹、药物热等过敏反应。
6、长期用药可致菌群失调，发生二重感染。
7、肌内注射或静脉给药时可致注射部位疼痛、硬结，严重者可致血栓性静脉炎。
