1、胃肠道反应有食欲减退、恶心、呕吐、口腔炎、胃炎、腹泻，严重者有血性腹泻。
2、骨髓抑制：白细胞及血小板下降，严重时可有全血象下降。
3、局部刺激：注射部位可引起静脉炎。动脉滴注可引起局部皮肤红斑、水肿、破溃、色素沉着。
4、神经系统：少数可有小脑变性、共济失调。
5、脱发、皮炎、甲床变黑等。
6、氟尿嘧啶毒性较大，有以下情况者应减量：
(1)一般状况差，蛋白质消耗或有吸收障碍者；
(2)广泛肝转移并有黄疸者；
(3)曾经接受大面积盆腔照射者；
(4)广泛骨盆转移者；
(5)过去曾多次用过化学治疗的病人；
(6)肾上腺皮质功能不全及过去作过肾上腺或垂体切除者。
7、氟脲嘧啶停药指标：
(1)腹泻每日5次以上或有血性腹泻者；
(2)白细胞降至3000/μl以下，血小板降到8万/μl以下以及血象急剧下降的病人；
(3)出现神经症状时；
(4)粘膜反应严重及色素沉着明显的病人。
8、剂量应严格掌握，过于肥胖或有水肿的病人可按体重计算。