主要用于治疗耐多种抗生素的金葡菌重症感染及对青霉素过敏的链球菌性心内膜炎的患者。另外，口服对难辨梭形芽胞杆菌性肠炎有较好疗效。以上感染均是临床上较难治疗的疾病，而万古霉素有较好的疗效，故本药在治疗这类感染性疾病中有重要的地位。万古霉素还可作为以下情况的预防用药：人工合成材料体内植入手术预防金葡菌感染；对青霉素过敏的病人进行口腔或上呼吸道手术；青霉素过敏的病人进行胃肠道、泌尿道手术或白血球减少伴发烧的免疫低下的病人。
