本组疾病的预后与原发中枢神经系统感染的类型、程度以及治疗的及时性有密切关系。例如，病毒性脑炎经抗积极抗病毒治疗后一般预后较好，重型病例的死亡率为22.4-60%；麻痹性痴呆为神经梅毒最严重的一种类型，病情进行性加重，预后差；HIV感染伴发痴呆是预后差的标志，50-75%的患者在伴发痴呆的6个月内死亡。
