伤口肉毒症的致病菌是肉毒梭状芽胞杆菌。主要致病物为肉毒梭状芽胞杆菌的外毒素、血细胞凝集毒素和神经毒素。后者干扰外周神经终端乙酰胆碱的释放，导致骨骼肌麻痹。
污染伤口局部组织的氧化还原电位（EH）降低和局部氧张力低下是伤口肉毒症的诱发因素。
