1.一般减毒活疫苗均保留一定残余毒力，对一些个体(如免疫缺陷者)可能诱发严重疾病。
2.由于种种原因(如基因修饰等)，减毒活疫苗有可能出现"毒力返祖"现象。
3.是活微生物制剂，可能造成环境污染、而引发交叉感染等。
4.缺损颗粒可能干扰疫苗的免疫效果。
5.产品的分析评估较为困难。
6.保存、运输等条件要求较高，如需冷链等。
