单纯疱疹病毒的核酸扩增实验法（NAATs），已成为确认疱疹感染的高灵敏度方法，临床标本包括生殖器溃疡、黏膜表皮部位及脑脊髓液等标本。PCR方法对无症状HSV病毒播散的检测特别有用。HSV NAATs扩增检测最大的限制是检验的费用。此类特别的样本要用涤纶（Dacron）擦拭棒收取并置于病毒传送培养液中：NAATs标本在4”C时可保存72h，若需长期保存标本应保持在-20”C。此NAATs比病毒培养法检测单纯疱疹病毒的灵敏度高四倍 [7] 。
