诊断应结合病史、食管pH值监测及治疗反应综合考虑。
诊断标准：
1.慢性咳嗽，以白天咳嗽为主；
2.食管24小时pH监测Demeester积分>14.70；3.排除咳嗽变异性哮喘（CVA）、嗜酸粒细胞性支气管炎（EB）鼻后滴漏综合征（PNDS）4.抗反流治疗后咳嗽明显减轻或消失。
抗反流治疗有效是诊断反流性咳嗽的最重要的标准，但抗反流治疗无效并无完全排除反流性咳嗽的存在，因为可能抗反流治疗力度不够，或者内科药物治疗无效，或者非酸反流等。对于高度重视反流性咳嗽的患者，可行诊断性治疗。诊断学治疗应持续1--3个月的时间、有些患者甚至需要2--3个月咳嗽方能缓解。