1.单纯性肾囊肿一般无临床症状，不影响肾功能，因此预后良好，也不影响患者的寿命。
2.多囊肾患者肾功能常呈渐进性减退，在无降压治疗时，同一家族的患者在相似的年龄段均进入尿毒症阶段。但在30%的多囊肾家族，也可在80～90岁仍未进入终末期肾衰。说明本病预后不一致。如经积极治疗，预后可以改观。
3.肾髓质囊性病患者临床表现和预后差异很大。有的预后良好，很少发生肾功能不全，有的呈慢性进行性肾功能不全，有不少不到青少年即出现肾功能不全。
