女性生殖器结核，当结核杆菌感染到一易感宿主后，局部组织首先出现多形核白细胞的炎性渗出，48小时内即被单核细胞所代替，并变成结核杆菌在细胞内繁殖复制的最初场所。当细胞免疫出现后，结核杆菌被消灭，组织发生干酪性坏死。以后如感染灶重新激活，乃引起增生性肉芽肿病损—结核结节。典型的组织图像：中央是干酪性坏死组织，四周围以同心层的类上皮细胞及多核巨细胞，其外周为淋巴细胞，单核细胞及成纤维细胞浸润。
女性生殖器官结核中输卵管是受累最多的部位，占90～100%，多为双侧性。子宫受累为50～60%，几乎全部在子宫内膜，很少侵入肌层。卵巢结核常从感染的输卵管直接蔓延而来，由于卵巢周围有一层坚韧的白膜，感染率低于子宫内膜，占20～30%，至少有一半为双侧性。宫颈结核来源于子宫内膜结核的下行感染，如作连续宫颈切片并不罕见，可占5～15%。阴道、外阴结核偶见，约占1%。