1.血象检查
外周血检查常见贫血，多为小细胞低色素性贫血。红细胞平均体积（MCV）、红细胞平均血红蛋白（MCH）、红细胞平均血红蛋白浓度（MCHC）的检测值都低于正常值，即可诊断为“小细胞低色素性贫血”。如果有叶酸和维生素B12吸收障碍，可为大细胞性贫血。活动期外周血白细胞计数升高。
2.血液检查
可见血浆白蛋白降低，低钙（低镁及低锌）血症、维生素D缺乏，血沉在活动期加快。
3.粪便检查
大便隐血试验呈阳性。
4.X线检查
包括钡餐和灌肠。早期只见规则的肥厚黏膜，呈结节状改变，肠管僵直、韧性差。长期慢性病变可见肠管黏膜皱襞增宽、平坦或裂隙条状存钡带，正常纹理消失，有时黏膜突起呈“鹅卵石征”，病变肠段蠕动减弱或消失，肠襻僵直呈铅管状。若有内瘘形成可出现钡剂分流，并出现溃疡龛影。
5.纤维结肠镜检查
可见结肠病变部位的黏膜炎症、溃疡，并可取活检，病理证实为非干酪性肉芽肿即可确诊。