军团菌病（legionnaires' disease）即军团菌肺炎，是由革兰阴性嗜肺军团菌所引起。该细菌是一种新型的致病菌，能引起肺炎和庞提阿克热两种感染。
本病的病原菌为军团菌，军团菌含有多种外毒素与内毒素，几种毒素的共同作用才引起疾病。嗜肺军团菌通过空气传播进入肺部，细菌进入肺组织后，病变主要位于肺泡，由肺泡逆行至呼吸性细支气管，再到较大的小支气管；少数延及间质或胸膜，淋巴管，胸导管与血循环，进入血液循环至肝、脾、肾和中枢神经系统等，造成多脏器损害。
儿童感染军团菌的危险因素有吸烟、被动吸烟、慢性疾病及应用免疫抑制剂。新生儿军团菌的高危因素有早产、先天性心脏病、支气管发育不良和接受激素治疗。