40%的病例并发于败血症或软组织化脓感染。致病菌常为溶血性金黄色葡萄球菌，近年来也有毒性较强的溶血性白色葡萄球菌，偶尔可见沙门杆菌、肺炎球菌或其他化脓菌，大部分对青、链霉素有抗药性。常见的原发病灶有脓疱、齿龈脓肿及上呼吸道感染。
1.间接因素
临床上，扭伤和挫伤等所致局部组织损伤，常为骨髓炎发生的间接原因。
2.机体因素
小儿长管状骨的干骺端和骨骺间的血运不直接相通，干骺端营养动脉的分支近端折回呈小襻状，再注入窦内较大静脉，该处血流速度减慢，成为致病菌滞留繁殖的理想条件，是小儿骨髓炎较成人多见的病理生理方面的原因。