（一）指诊：
可触到直肠粘膜弹性减弱，粗糙呈颗粒状突起或有疤痕。
（二）直肠镜检查：
可见粘膜水肿、肥厚，色黄白，被覆粘液，擦去粘液，可见粘膜表面不光滑，个别部位有糜烂。慢性直肠炎镜检的特点是：粘膜肿胀、肥厚，表面呈粗糙颗粒、有少量粘液，萎缩性直肠炎镜下可见：粘膜干燥、色灰白，粘膜下可见血管网。
（三）细菌培养和活体组织检查，可确定病因诊断。
