大体可见脑呈海绵状变,皮质、基底节和脊髓萎缩变性;显微镜下可见神经元丢失、星形胶质细胞增生、海绵状变性,即细胞胞浆中空泡形成和感染脑组织内可发现异常PrP淀粉样斑块,无炎症反应。变异型CJD的病理学改变为海绵状变性以丘脑最为明显,且海绵状区域出现的PrP阳性的淀粉样斑块与传统的类型不同。