抗真菌免疫—至今还了解不多。在已知的非特异性免疫中，皮肤分泌的脂肪酸有抗念珠菌的作用，阴道分泌的酸性分泌物也有抑制念珠菌的能力。长期应用广谱抗生素可造成菌群失调，导致真菌感染。
在真菌感染中虽然出现体液抗体，但有关它的防御作用现在还没有定论，只是以抗体的存在作为感染的反映而矣。在缺乏T细胞的患者中，真菌感染的发病率增高，这表明细胞免疫起主要作用。在播散性真菌感染中，常会发现T细胞功能低下，但目前还不清楚这种现象究竟是原因还是结果。真菌感染大多是慢性感染，常伴随着超敏反应（Ⅳ型变态反应），因此，可用真菌提取物即真菌素（毛癣菌素、念珠菌素等）作皮肤试验。这种试验既可反映是否感染，也可显示机体的细胞免疫状态，因而成为检测机体细胞免疫的常用方法之一。