(一)食管下括约肌功能不全
(二)食管体部的清除下降
食管体部蠕动减弱，使其对反流物的容量清除下降，唾液分泌减少。也影响反流物的化学清除作用。
(三)胃排空延缓
约l1/2的胃食管反流性疾病患者有胃排空延缓，这在卧位时格睡前进餐或饮料)容易促发胃食管反流。
(四)食管激膜的屏障作用
食管表层有多层排列紧密的鳞状上皮细胞覆盖，我膜表面效液附着，可防胃蛋白酶的消留化；鼓膜表面还有HCO-离子，能中和部分反流的H+，这些组成了食管上皮前的防御屏障。新膜血流及其酸碱状态等是食管上皮层屏障。胃食管反流程度和食管部膜损害程度并不平行，个体差异较大，显然与食管部膜的屏障作用有关。