临床怀疑小肠疾病，而其他常规检查方法不能明确者，或临床医师确定须行小肠镜检查者。如：
1.原因不明的腹痛，经X线钡餐检查无阳性发现或疑有小肠病变者。
2.原因不明的消化道出血，疑小肠病变者。
3.疑小肠良、恶性肿瘤者。
4.小肠吸收不良综合征。
5.疑小肠淋巴管扩张症。
