1.尿液常规检查
（1）尿液采集 新生儿尿培养尿标本采集的常用方法有集尿袋和导尿法。
（2）尿液常规检查 尿液沉淀后沉渣镜检，如白细胞>10个/高倍视野；或不离心尿标本的镜检，白细胞>5个/高倍视野，即应考虑为泌尿系感染。如尿中有管型尤其颗粒管型，提示肾实质已受损。
2.尿液直接涂片找菌
混匀的新鲜尿，亚甲蓝或革兰染色，若在油镜下每个视野均能找到1个以上细菌，则表明尿内细菌在105/ml以上，有诊断意义。
3.尿培养及菌落计数
是确诊的重要依据。采集此标本尿液的最佳方法是用耻骨上膀胱穿刺术采取尿标本，尿液采取后立即做细菌培养，若有细菌生长即可诊断。
4.尿液其他辅助检查
尿溶菌酶、亚硝酸盐还原试验和氯化三苯基四氮唑试验可作为辅助诊断。
5.其他检查
如经久不愈或反复发作时，应做进一步检查，包括腹部平片、静脉肾盂造影、膀胱尿路造影、超声波、肾扫描、肾图等，以了解有无畸形或功能异常。