1.直接镜检
取痰、脓液、耵聍、皮损破溃分泌物、支气管肺泡灌洗液或活检组织标本等做直接镜检。
2.培养
室温沙氏培养基上菌落生长快，毛状，有黄绿色、黑色、棕色等。镜下可见分生孢子头和足细胞等曲霉特征性结构。
3.组织学检查
曲霉病的组织病理反应一般为化脓性或混合性炎症反应。
4.曲霉免疫学检测
（1）曲霉特异性抗体检测 主要应用于免疫功能正常者，方法有免疫双扩散试验（ID）、对流免疫电泳（CE）或乳胶凝集试验（LPA）等。可用于诊断过敏性曲霉病、肺曲霉病、慢性坏死性曲霉病及其他免疫功能正常者的侵袭性曲霉感染，包括心内膜炎等。过敏性曲霉病的阳性率为70%以上，而肺曲霉球阳性率大于90%，但侵袭性曲霉病的阳性率较低。
（2）特异性抗原检测 血清曲霉特异性抗原检测，简称GM试验，主要应用于血液系统恶性肿瘤患者侵袭性曲霉病的早期诊断，具有较好的敏感性和特异性，其次也可用于实体器官移植患者。
（3）分子生物学检测 主要是应用实时PCR（聚合酶链反应）技术对血液、支气管肺泡灌洗液中曲霉特异性DNA片段进行检测，具有较好的敏感性和特异性。但是目前该技术尚未被正式批准临床常规应用，主要与其假阳性和标准化问题尚未完全解决有关。