未进行眼局部给药的药代动力学研究；据文献资料报道，更昔洛韦口服吸收差。一次口服3g，血药浓度值可达到1.0～1.2mg／L，静脉滴5mg／kg(一小时内)则为8.3～9.0mg／L。空腹服药后，生物利用度为5％，进食后服药则为6％～9％。本药在体内广泛分布于各种组织中，并可透过胎盘而进入眼内组织。在脑脊液内的浓度为同期血药浓度的7％～67％，分布容积(Vd)达0.74L/kg。蛋白结合率低，为1％～2％。本药经静脉滴注的半衰期(t1/2β)为2.5～3.6小时，口服则为3.15～5.5小时，肾功能减退者可分别延长至9～30小时(静注)和15.7～18.2小时(口服)。药物在体内不代谢，主要以原形经肾排泄，可经血液透析或腹膜透析清除。