病因诊断取决于本病的发生部位。下肢的SVT，主要病因仍然是静脉曲张。静脉曲张的局部损伤常为SVT发生的促发因子。在特发性、游走性或者复发性SVT或者无静脉曲张时，需要确定是否存在其它的病理状态如自身免疫性疾病（特别是白塞氏病和伯格氏病）、恶性肿瘤和易栓状态，包括：因子V Leiden基因变异、凝血酶原G202010A基因变异、肝素辅因子2缺陷、蛋白S和蛋白C缺陷，抗凝血酶III缺陷、狼疮抗凝物和抗磷脂抗体缺陷、纤溶活性异常、口服避孕药、激素替代治疗、妊娠、肥胖、长期制动、最近的外科手术、创伤、硬化疗法、静脉血栓栓塞病史、静脉输注低张和高张溶液、使用药物（包括安定、胺碘酮、万古霉素、海洛因）和静脉插管。
对于上肢和颈部的SVT，主要病因由医源性介入操作如静脉穿刺插管或者静脉注射药物（化疗、吸毒）组成。Mondor’s病，主要影响胸壁和女性乳房的浅静脉，在大多数情况下是特发性的，但是有时与剧烈运动或者创伤有关，在个别情况下，与乳腺癌或者易栓症有关。