溶葡萄球菌酶具有多个催化活性中心,其中内切肽酶、糖苷酶和酰胺酶3个活性域与水解细菌胞壁肽聚糖交联结构的催化活性有关以内切肽酶活性最为重要。除作用于细菌胞壁外,溶葡萄球菌酶还具有结合并降解弹性蛋白质(elastin)的作用,弹性蛋白质的氨基酸序列中约1/3为gly,但溶葡萄球菌酶降解弹性蛋白质的特异性不同于水解肽聚糖gly五肽桥联的活性,对前者的特异性与N端的Ala-Ala-Thr-His-Glu 序列与有关,后者的特异活性域则偏C 端 [2]。