甲减常以心血管系统异常表现突出，非专科医师往往误诊为冠心病。下列几点有助于鉴别：
（1）甲状腺功能减退以女性多见：而冠心病常见于男性。
（2）甲状腺功能减退心率一般较缓慢：而冠心病则心律相对较快，尤其当病情加重时。
（3）单纯甲状腺功能减退性心肌性心肌病心绞痛较少见：由于组织耗氧和心排血量相平行，故心肌耗氧量虽减少，但很少发生心绞痛。
（4）T4代替心绞痛消失，心律失常或心室扩大可逆转。
（5）甲状腺功能减退的全身表现。
（6）甲减时血T3、T4降低：TSH增高。据报道，1例成年人甲减误诊为冠心病长达9年，直至出现黏液水肿性昏迷危及生命才确诊。因此，在遇到甲减患者合并心绞痛时，可参考上列鉴别要点进行鉴别，其治疗和预后均不一样。李科民等报道的6例中有5例是反复利尿、强心、扩血管治疗无效后开始怀疑甲状腺功能减退性心肌性心肌病的。
值得注意的是，甲减合并缺血性心肌病发生率甚高。其重要原因为甲状腺功能减退时高胆固醇血症的存在，低密度脂蛋白胆固醇（LDL-C）增高，高密度脂蛋白胆固醇（HDL-C）降低，冠脉易发生硬变。另外，甲减患者红细胞内2，3-二磷酸甘油酯水平降低致使其携氧功能障碍且去甲肾上腺上腺上腺素（NE）浓度及分泌率增高，易发生冠脉痉挛。