1、西医治疗：
西医认为子宫内膜异位症的发生、发展和消退是在内分泌控制下进行的，因此，应用激素治疗有效。治疗目的为治愈疾病、防止复发、促进生育。药物治疗效果以轻、中度内异症为佳，可缓解症状，增加受孕率;重症患者病灶较大，纤维化多，粘连紧密。尚需手术治疗。
2、中医治疗：
中医认为盆腔子宫内膜异位症发病与月经周期有密切关系，治疗痛经结合月经时期及不同体质论治。一般经前以调气化瘀为主;经期以活血化瘀、理气止痛为主;经后以益气补肾、活血化瘀为主。若伴月经过多，在月经期尚需化瘀止血。子宫内膜异位症诸多症状表现其直接发病，病机为“血瘀”，而“血瘀”又有寒、热、虚、实之区别。临床治疗在立足于基本病机的基础之上，又应当辩其虚实夹杂，特别是针对其临床主要的症状表现，结合适当的辩病与辩证相结合，或补肾、活血化瘀以调经、或补肾活血促排卵助孕、或活血化瘀散结。
本病非单纯气血瘀滞，而属虚实夹杂，本虚标实之证，在本者为脾肾之虚，在标者为气滞血瘀，故温宫内异汤治疗上采用标本兼治之法。