1、直肠子宫内膜异位症的遗传因素：
子宫内膜异位症患者中其姐妹（5.9%）及母亲（8.1%）目前也患有子宫内膜异位症，而在患者丈夫的女性一级亲属中，发病率仅为1%。因此，有学者认为此病是一种免疫监视功能混乱的遗传性疾病。
2、直肠子宫内膜异位症的生理因素：
生殖道梗阻加剧经血逆流，容易使子宫内膜异位症病情进展。因此子宫内膜异位症更容易发生于残角子宫、处女膜闭锁和阴道横膈的患者中。
3、直肠子宫内膜异位症的环境因素：
2，3，7，8-四氯苯二恶英（TCDD）是最常见的环境毒素。TCDD通过与雌激素结合刺激子宫内膜异位症形成。