短杆菌素是由短杆菌产生。含两种抗生素，一种为中性的短杆菌肽，约占20%；另一种为碱性酌短杆菌酪肽，约占80%。短杆菌素用丙酮-乙醚混合物处理，短杆菌肽即溶解在此混合溶剂中。不溶解部分可在乙醇-盐酸中结晶，即得短杆菌酪肽。后者用逆流分溶法可分出A、B、C三种组分，均为环状多肽。它们之间的区别为：短杆菌酪肽A中L-苯丙氨酸如以L-酪氨酸代替即得B；以D-和L-酪氨酸分别代替A中的D-和L-苯丙氨酸，即得C。短杆菌酪肽A的结构见图，B和C的结构可由此推得。
