⑴间隙连接在代谢偶联中的作用：使代谢物（如氨基酸、葡萄糖、核苷酸、维生素等）及第二信使（cAMP、Ca2+等）直接在细胞之间流通。
①间隙连接允许小分子代谢物和信号分子通过, 是细胞间代谢偶联的基础
②代谢偶联现象在体外培养细胞中的证实
③代谢偶联作用在协调细胞群体的生物学功能方面起重要作用.
⑵间隙连接在神经冲动信息传递过程中的作用：在由具有电兴奋性的细胞构成的组织中，通过间隙连接建立的电偶联对其功能的协调一致具有重要作用。
例如：神经细胞之间的电偶联（带电离子，一般为H+，通过间隙连接通道由一个细胞内直接进入另一个细胞内）使动作电位迅速在细胞之间传播，从而没有化学突触传播兴奋时出现的时间上的延迟。
①电突触快速实现细胞间信号通讯
②间隙连接调节和修饰相互独立的神经元群的行为
⑶间隙连接在早期胚胎发育和细胞分化过程中具有重要
①胚胎发育中细胞间的偶联提供信号物质的通路,从而为某一特定细胞提供它的“位置信息”，并根据其位置影响其分化。
②肿瘤细胞之间间隙的连接明显减少或消失，间隙连接类似“肿瘤抑制因子”。
⑷间隙连接对细胞增殖的控制也有一定作用。如将转化细胞与正常细胞共培养，通常几乎不能在两种细胞间建立间隙连接，转化细胞的增殖不受抑制；当用一定诱导剂使转化细胞与正常细胞之间建立间隙连接后转化细胞的生长即受到抑制；当封闭正常细胞与转化细胞之间的通道后转化细胞的生长失控复现。
⑸间隙连接的通透性是可以调节的。
①降低胞质中的pH值和提高自由Ca2+的浓度都可以使其通透性降低
②间隙连接的通透性受两侧电压梯度的调控及细胞外化学信号的调控