病因
细菌性肠炎的病原菌可分产肠毒素性和侵袭性两大类。不同病原菌引起的肠炎，有不同的发病机理和临床表现。
肠毒素性细菌性肠炎：
如霍乱，发病机理是致病菌粘附而不侵入肠粘膜，在细菌生长繁殖过程中分泌肠毒素，和小肠粘膜的上皮细胞膜受体结合，激活细胞膜上的腺苷酸环化酶，在该酶的催化下，使细胞内的三磷酸腺苷(ATP)转化成环磷酸腺苷(cAMP)。当细胞内cAMP的水平升高时，通过一系列的酶反应，使小肠粘膜大量分泌水和电解质，潴留在肠腔内引起水泻，称为“分泌性腹泻”。此类病人除小肠粘膜上皮细胞有分泌亢进外，肠道的病理改变往往没有或者很轻。
侵袭性细菌性肠炎：
如细菌性痢疾，致病菌粘附并侵入肠粘膜和粘膜下层，引起明显的炎症。不同的病原菌侵犯肠的部位不同，有的侵犯小肠为主，有的侵犯结肠为主，有的引起小肠和结肠炎症。
症状
发热、腹泻、粪便有粘液或脓血、大便有腥臭味，有的有里急后重感，即使后仍有余便未尽的感觉。
肠毒素性细菌性肠炎：
病原体主要感染小肠，因此基本临床表现是腹泻次数较多，为大量水样便，无脓血，一般无腹痛，无里急后重感,常伴有呕吐，容易发生脱水、电解质紊乱及酸中毒，全身中毒症状较轻。
侵袭性细菌性肠炎：
此类肠炎的基本临床表现是：全身毒血症明显，有高热,重症病人可发生感染性休克。大便可呈粘液脓血便，便量少，便次多。腹痛明显，呈阵发性绞痛。