1、结直肠子宫内膜异位症的体格检查
盆腔检查时要注意子宫直肠陷凹，子宫骶骨韧带或后穹隆处有触痛、增厚或硬结等则高度提示子宫内膜异位症的存在。
2、结直肠子宫内膜异位症的乙状结肠镜或电子结肠镜检查
可见肠道狭窄，黏膜却光滑和光整，但有皱缩和充血，有溃疡者少见。如黏膜有可疑，应取活体组织做病理检查。
3、结直肠子宫内膜异位症的影像学检查
超声和CT以及钡餐（钡灌肠）等检查对发现病灶的部位、大小、范围等有帮助。偶能发现盆腹腔未能扪及的包块。
4、结直肠子宫内膜异位症的腹腔镜检查
可以直接看见病灶部分、病变范围、严重程度，而且可活检，是目前诊断子宫内膜异位症最可靠的方法之一。
5、结直肠子宫内膜异位症的细针穿刺吸引细胞学检查
对于直肠陷凹或直肠阴道隔的肿块，可经阴道用此法做细胞学检查。