结直肠子宫内膜异位症的发生机制比较复杂，有以下3种学说：
1.Sampson转移学说
认为是月经期间子宫内膜细胞经输卵管反流到盆腔所致，是腹腔内异位的主要原因；
2.Ferguson化生学说
认为是体腔上皮转变为与子宫内膜形态和功能相同的组织；
3.免疫学说
目前的研究发现子宫内膜异位患者T细胞介导的细胞毒性、自然杀伤细胞活性、B细胞功能、补体水平均有异常，因此认为低免疫功能状况可能与发病有关。
