病变多发生于直肠和乙状结肠，也可上升累及降结肠或整个结肠，累及到回肠末端。在早期，结肠粘膜呈水肿、充血、出血、颗粒状等病变。此后形成不规则的小溃疡，继则融合成为不规则的大片溃疡。溃疡愈合时的大量瘢痕形成，可导致结肠缩短及肠腔狭窄，粘膜表面有炎性息肉形成(假息肉)。溃疡性结肠炎的炎症病变局限于粘膜层或延伸到粘膜下层，较少深达肌层。病变从大肠远端向近端发展，呈连续性分布，但也偶有呈节段性分布，此时应注意与局限性肠炎病相鉴别。
