肺炎克雷伯菌可引起原发性大叶性肺炎，老年病人、酒精中毒以及患有糖尿病、癌肿、血液病等严重原发疾患者易发生。病理变化与肺炎球菌所致者不同，肺泡壁常坏死、液化，形成单个或多个脓腔。肺泡内含大量血性粘稠痰。肺炎克雷伯菌感染占医院内感染的10%，常见者如：尿路感染、呼吸道和伤口感染等。肺炎克雷伯菌在各脏器可形成单个或多发性脓肿，其中合大量带荚膜的细菌。败血症病例中肝、肾、脑等均可出现多发性化脓病灶，胸腔及心包腔积脓等。
肠杆菌属、沙雷菌属和哈夫尼亚菌属可引起各种医院内感染，如：尿路、伤口感染等，但国内临床上由后两种菌属引起者较少见，克雷伯菌属的多种细菌均可污染静脉输液而造成败血症暴发流行。文献曾报道由于使用同一药厂生产的静脉输液；某国25家医院内发生378例由凝团肠杆菌和阴沟肠杆菌引起的败血症，此外，亦有报道由于导尿管、纤维支气管镜、静脉针头及静脉输液等污染而引起沙雷菌属医院内感染暴发流行。