肺炎链球菌脑膜炎在冬春季节发病较多，与呼吸道疾病的流行有密切关系。多见于1岁以下婴儿，约占婴儿化脓性脑膜炎的80%。
近20多年，肺炎链球菌的耐药菌株(PRP)在不断增加，中度耐药株已在全世界发现，而高度耐药株也在许多国家出现。北京地区耐青霉素的肺炎链球菌达15%以上。耐药基因是逐步获得的，具有多基因特性。耐药的发生是由于PRP耐青霉素结合蛋白(PBPs)特别是PBP1和PBP2改变所致。对青霉素敏感性降低的菌株，通常与其他抗生素有交叉耐药最常见对所有β-内酰胺类抗生素、氯霉素、利福平等耐药，但对万古霉素敏感
发病季节与呼吸道疾病流行有密切关系，常继发于上感、肺炎、中耳炎及乳突炎之后。有些病儿原发病灶不易找出。少数患儿继发于颅底骨折、颅骨外伤或脑外科手术后有先天畸形如皮样窦道、脑脊膜膨出、椎管畸形的小儿，细菌常可由此侵入致病。小儿4岁前施行脾切除术后发生暴发型败血症时，也易见本症。