SBP的致病菌大多为需氧菌，>90%的为单一菌种感染，病原菌主要来自于肠道菌群，少数来自于泌尿道、呼吸道和软组织感染灶。革兰氏阴性杆菌占45%-55%，以大肠埃希菌最为常见，其次为肺炎克雷白杆菌。革兰氏阳性球菌，占10%-34%。常见肺炎链球菌及其它链球菌属，其它少见的细菌有葡萄球菌、粪肠球菌、产碱杆菌、流感嗜血杆菌、猪霍乱沙门氏菌等。由于腹水中氧的浓度很高，故厌氧菌和非需氧菌感染少见。
