1.艾滋病
（1）免疫功能检查：CD4+T淋巴细胞耗竭，外周血淋巴细胞显著减少，CD4+T淋巴细胞<200/μl，CD4/CD8<1.0（正常为1.25～2.10），迟发型超敏反应皮试阴性，有丝分裂原刺激反应低下，自然杀伤细胞（NK细胞）活性下降。
（2）人类免疫缺陷病毒抗体检测：采用酶联免疫吸附试验（ELISA）、明胶凝集试验、免疫荧光检测、免疫印迹检测、放射免疫沉淀法等，其中前三项常用于筛选试验，后二者用于确证试验。
（3）人类免疫缺陷病毒抗原检测：采用酶联免疫吸附试验测定血清中人类免疫缺陷病毒P24抗原，能帮助判断病毒复制水平，对“窗口期”人类免疫缺陷病毒感染者早期确诊有临床意义。
（4）人类免疫缺陷病毒病毒定量检测：包括血浆或淋巴细胞病毒培养定量检测、血浆病毒RNA定量检测（又称血浆病毒载量）和淋巴细胞内cDNA定量检测。其中血浆病毒RNA定量检测敏感、准确，是最常用的方法。
2.乙型病毒性肝炎
（1）乙型肝炎病毒（HBV）标志物检测：①乙型肝炎病毒表面抗原（HBsAg）和乙型肝炎病毒表面抗体（HBsAb）的检测；②乙型肝炎病毒核心抗原（HBcAg）和乙型肝炎病毒核心抗体（HBcAb）的检测；③乙型肝炎病毒e抗原（HBeAg）和乙型肝炎病毒e抗体（HBeAb）的检测。
（2）乙型肝炎病毒DNA（HBV DNA）检测：血清HBV DNA是乙型肝炎病毒复制和传染的直接证据。
3.丙型病毒性肝炎
（1）抗丙型肝炎病毒（HCV）抗体检测：丙型肝炎病毒感染后，机体可产生相应的抗体，最早出现的抗体是针对病毒核心壳区C22蛋白的抗体（抗C22抗体），随后是针对NS3区C33蛋白抗体（抗C33抗体）的产生，该抗体滴度低于抗C22抗体，但高于最后出现的抗C100抗体。
（2）丙型肝炎病毒RNA（HCV RNA）检测：感染丙型肝炎病毒几天内，即在谷丙转氨酶（ALT）升高及抗丙型肝炎病毒抗体出现前几周，即可测出HCV RNA，因此HCV RNA可作为丙型肝炎病毒感染的早期诊断指标，也可作为丙型肝炎病毒复制、转归及有无传染性的指标。