链球菌肺炎的抗菌治疗应尽早开始。
（1）青霉素水剂，每12小时肌注1次；如有休克可改静脉注射，或至体温降至正常后72小时为止。停药过早易致复发。如患者能口服而不适于注射给药，可先予一针普鲁卡因青霉素，继以口服青霉素V。如患者对青霉素治疗反应不佳，应考虑是否存在下列原因：①并发脓胸、心内膜炎、脑膜炎、肿瘤导致肺化脓症；②其他病菌所致肺炎或病原菌耐药；③青霉素过敏所致药物热；④诊断错误时，有时开始治疗有效，继续治疗则无效。
（2）头孢噻吩肌注或静注。有效但偶见有与青霉素交叉过敏性，宜在用药前用头孢噻吩作过敏试验；
（3）头孢唑林肌注或静注。
（4）红霉素口服，对红霉素耐药者极少见。