厌氧链球菌性肌炎的致病菌是消化链球菌，广泛存在于自然界中，是人、畜口腔、肠道和泌尿生殖道和皮肤的正常菌群之一，故属于条件致病菌。它有9个种属，在外科感染中重要的是厌氧消化链球菌、微小消化链球菌、不解糖消化链球菌和大消化链球菌。它们常和需氧菌（如B族链球菌肠杆菌、葡萄球菌等）或其他厌氧菌（如类杆菌等）形成混合感染。（厌氧链球菌性肌炎几乎都是混合感染）其致病物主要为强有力的外毒素和一系列高度活性的酶类。污染较重的创伤和手术是最常见的诱发因素，局部肌肉缺血、缺氧也容易诱发该病。
