恶性黑色素瘤患者的预后依赖于诊断时的分期，总体预后不佳。
I/II期恶性黑色素瘤预后相关的因素还包括年龄、性别和原发部位。I/II期女性存活率高于男性；原发黑色素瘤的位置在躯干、头部及颈部比发生在四肢的预后差。年龄与黑色素瘤存活率成反比。
局部、没有淋巴结及远处转移的患者，预后相对较好。
III期恶性黑色素瘤具有明显不同的预后。研究显示，没有溃疡但仅有单一隐蔽淋巴结转移的黑色素瘤患者，五年生存率为69%，原发黑色素瘤出现溃疡四个或更多淋巴结转移的患者，五年生存率仅为13%。
IV期恶性黑色素瘤患者中，重要的预后因素是远处转移的位置，内脏转移比非内脏（如皮肤、皮下及远处淋巴结）转移预后差。近来一项研究表明，IV期黑色素瘤中位生存时间是7.5个月，5年生存率为6%。