鼠疫耶尔森菌属肠杆菌科耶尔森菌属，双极着色、革兰阴性小杆菌，无鞭毛、无芽孢、有荚膜。兼性需氧。在血液琼脂或Maclonkey 培养基中生长良好，产生典型的粗糙型菌落。
此菌有多种抗原，与致病性与免疫原性有关的有F、T、V3 种。我国鼠疫耶尔森菌可分为5 群(A-E)17 个生态型。
此菌抵抗力较弱，特别是对热和干燥敏感，日晒、煮烤和常用消毒剂均可被杀灭。耐低温，在脓液中可存活10～20 天，蚤体内1 个月，尸体中可存活数周至数月。
