内标法和外标法是同样可靠的。
内标的优点在于目标基因与管家基因的反应条件最接近一致，缺点在于目标基因与管家基因的引物和探针相互之间会发生竞争与抑制，导致它们的 PCR 效率有差异。
外标的优点在于目标基因与管家基因的引物和探针之间没有发生竞争与抑制的机会，但是不同管之间的反应条件差异比同管的要大，也会导致它们的 PCR 效率有差异。
两相比较，内标法与外标法的数据精确度是一样的。
