发布时间:2020-06-01 15:21 原文链接: 冠层分析仪能测出玉米哪些数据

  目前,以有效的方式收集有用、可解释和与生物学相关的表型数据仍然是植物育种、基因定位和基因组预测的瓶颈。自主且价格合理的冠层Rovers是一种高效且可扩展的方法,可用于生成基于传感器的田间作物数据集。装有激光雷达的Rover可以对整个杂交玉米(Zea mays L.)田进行三维重建。

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表型分析方法的比较。

  本文收集了2103份玉米杂交田间激光雷达扫描图,并通过潜在空间表型分析从中提取了表型数据。研究人员首先通过两种方法(主要成分分析和卷积自动编码器)进行了潜在空间表型分析,以提取有用、定量的潜在空间表型(LSPs),从而描述整个植株的结构和生物量分布。结果发现:LSPs具有高达0.44的遗传力,与人工测量结果相似,这表明可以选择它们对玉米进行遗传定位。另外,利用LSPs作为偏最小二乘回归的解释变量,可以成功地预测人工测量特征,说明LSPs包含与植物结构相关的生物学信息。综上所述,该技术能够以较低成本和自动化方式评估作物结构,应用于育种、研究以及创建作物生长模型。

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工作流程示意图

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潜在空间表型(LSP)预测人工测量特征的能力

  来源:

  Gage J L., Richards E, Lepak N, et al. In-Field Whole-Plant Maize Architecture Characterized by Subcanopy Rovers and Latent Space Phenotyping. The Plant Phenome Journal. doi:10.2135/tppj2019.07.0011.


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