科学家们用冷冻电镜(cryo-EM)成像了代谢酶与其抑制剂的结合,获得了空前的高分辨率。他们认为,这种技术将为药物研发带来一场革命。
了解一个酶与药物结合时的精确结构,就可以更好的设计药物来阻断或者增强酶的活性。美国国立癌症研究所NCI(隶属NIH)的Sriram Subramaniam博士领导研究团队,对β-半乳糖苷酶(beta-galactosidase)及其抑制子PETG(phenylethyl-beta-D-thiogalactopyranoside)进行了高分辨率成像(2.2 Å),并将结果发表在五月七日的Science杂志上。
“以成像人类蛋白为基础的药物研发进入了新时代,”NIH主管Francis S. Collins博士说。“近原子水平的蛋白结构,为理解细胞过程提供了极为详细的信息。”
药物研发人员往往要分析小分子与蛋白质的互作,而且分辨率越高越好。现在Subramaniam等人达到了cryo-EM成像迄今为止的最高分辨率(2.2 Å),此前只有X射线晶体衍射达到过这种水平的分辨率。这能为人们提供足够的结构信息,进行更好的药物研发。
用cryo-EM进行结构分析时,需要在液氮温度下瞬间冷冻蛋白质悬液,让蛋白质分子周围的水分保持类似液体的状态,然后再通过成像解析蛋白分子的三维结构。1995年,Richard Henderson曾作过一个大胆的预测:在理想条件下,冷冻电镜(cryo-EM)检测蛋白结构应该可以达到3 Å的分辨率。现在研究者们已经成功突破了这一理论极限。
“cryo-EM技术允许我们成像相对较小的蛋白,在接近天然环境的条件下获得高分辨率结构,蛋白结构不受结晶过程的影响。这些优势使其成为了革命性的技术,”Dr. Subramaniam说。
研究人员用大约四万张分子图像,建立了β-半乳糖苷酶结合PETG的结构模型。他们明确了PETG的结合位点,揭示了复合体中的离子和水分子,获得了极为详细的氨基酸排列。
Dr. Subramaniam及其同事近年来用cryo-EM研究了一系列有重要医学意义的分子,比如HIV的包膜糖蛋白以及脑细胞中的谷氨酸受体。而这项研究是分辨率最高的一次结构分析。
“Cryo-EM逐渐成为了结构生物学和癌症药物研发中的强大工具,” NCI 的Douglas Lowy说。“就算是难以结晶的蛋白,Cryo-EM也很容易获得高分辨率的三维结构。”
美国加州大学旧金山分校科学家发现,大脑衰老背后隐藏着一种名为FTL1的关键蛋白。实验显示,过量FTL1蛋白会导致小鼠记忆力衰退、大脑神经连接减弱以及细胞反应迟钝。一旦阻断这种蛋白,老年小鼠就能恢复年轻......
中国科学院上海药物研究所研究员罗成、周兵、陈奕和华东师范大学研究员陈示洁合作,提出“强支点占据-杠杆干扰”(FOLP)的蛋白-蛋白相互作用(PPI)先导化合物设计策略,为PPI领域研究提供新的概念和方......
水稻作为最重要的粮食作物,为超过半数的世界人口提供主食。然而,水稻黑条矮缩病毒(SRBSDV)等病毒严重危害水稻生长,威胁粮食生产安全,解析病毒—水稻互作的分子机制对水稻病毒病的防控具有重要意义。近日......
给快中子射线戴上“高清眼镜”,让它看得更清楚。记者22日从中国科学院理化技术研究所获悉,来自该所等单位的科研人员,开发出一种新型透明玻璃材料。该材料能显著提升快中子成像的清晰度,使其达到当前报道的世界......
记者从安徽农业大学获悉,该校王晓波教授团队联合中国农业科学院作物科学研究所邱丽娟、李英慧研究员团队,解析了关键基因对大豆种子油脂和蛋白比例(油蛋比)的调控机制,为高油或高蛋白大豆品种选育提供了新方向。......
近日,电子科技大学自动化工程学院核探测技术与成像团队针对传统密度成像工具在薄层识别中存在分辨率低、测量误差大以及放射性风险高等问题,提出了一种基于可控X射线源的新型成像方法,并结合优化的Fisher分......
中国科学院院士施一公团队解析了BAX线状/环状聚合物所共享的基本重复单元结构,解答了“死神”BAX究竟是如何让细胞走上死亡命运的不归路。6月27日,相关研究成果发表在《科学》。BAX多边形结构。课题组......
近日,电子科技大学自动化工程学院核探测技术与成像团队针对传统密度成像工具在薄层识别中存在分辨率低、测量误差大以及放射性风险高等问题,提出了一种基于可控X射线源的新型成像方法,并结合优化的Fisher分......
近日,中国科学院合肥物质科学研究院研究员王俊峰团队依托稳态强磁场实验装置磁性测量系统,构建了用于非酒精性脂肪肝早期肝纤维高效诊断的生物型核磁共振成像(MRI)纳米探针。非酒精性脂肪肝病是患病率较高的代......
3月21日,国家重大科技基础设施——多模态跨尺度生物医学成像设施在北京怀柔科学城通过国家验收。该设施是“十三五”国家重大科技基础设施建设项目,将为生命科学研究和重大疾病诊治提供全尺度、多模态的成像技术......