凝缩蛋白在染色体组装和压缩中起着至关重要的作用，但其实现功能的机制尚不清楚。一种观点是这种蛋白随机地抓住杂乱的DNA的某个地方，将这些DNA系在一起；另一种观点是这种蛋白将DNA向内挤压，产生一种环，2017年以标题“The condensin complex is amechanochemical motor that translocates along DNA”发表在Science上的研究支持这种环挤压（loop-extrusion）观点。
研究人员使用单分子成像（single-molecule imaging）技术证明酿酒酵母凝缩蛋白具有这种机制所需的马达功能，它能够沿着DNA进行依赖于ATP水解的移动。凝缩蛋白的移动是快速的，并且前进能力很强，单个复合物能以每秒60碱基对的速度移动平均距离不少于1万碱基对。凝缩蛋白的步长可能与其约50纳米的卷曲螺旋（coiled-coil）亚基相当，表明其移动机制不同于任何之前报道的DNA马达蛋白。