发布时间:2014-02-20 15:04 原文链接: 北京师范大学PNAS发布新型肿瘤分类法

  将癌症进行分类可为临床治疗及机制研究提供重要的指导。来自北京师范大学、首都医科大学和隆德大学等处的研究人员,基于EGFR和PDGFRA共表达模块建立了一种新型的神经胶质瘤分类法。这一研究成果发表在《美国科学院院刊》(PNAS)杂志上。

  北京师范大学的樊小龙(Xiaolong Fan)教授和首都医科大学的江涛(Tao Jiang)教授是这篇论文的共同通讯作者。

  神经胶质瘤是人类中枢神经系统最常见的原发性癌症,目前治疗以手术为主,辅以放疗和化疗,因恶性程度不同疗效不一,因此有待进一步发现能够显著改善生存率的有效治疗方法。由于细胞形态只是细胞骨架重塑的一种表现形式,对神经胶质瘤进行形态学诊断与其发病机制缺乏密切相关性,有可能大大阻碍我们了解神经胶质瘤的发病机制。

  神经胶质瘤研究领域打算建立一些可以指导机制研究和治疗的分子分类法。目前流行的分子分类法都是基于对转录组或DNA甲基化组的无偏倚分析,不能预测患者的生存情况,或定义具有显著不同基因组异常的神经胶质瘤分子亚型。在神经起源和神经胶质瘤发病机制中存在着一些保守的关键信号通路,研究人员推测或许可以基于围绕这些关键信号通路的基因网络对神经胶质瘤进行分类。

  在这篇文章中,研究人员确定了神经胶质瘤中围绕生长因子受体(EGFR)的基因共表达模块(EM)以及围绕血小板衍生生长因子受体(PDGFRA) 的基因共表达模块(PM),EM包含有29个基因,PM则包括有40个基因。他们将共表达的EM和PM基因作为分类器。基于这些基因共表达模块,研究人员建立了新型的神经胶质瘤分类法。基于EM和PM表达标签,新的分类法将来自三大洲4个独立数据库的1369个WHO分级为II-IV的弥漫性神经胶质瘤以独立于形态学的方式分为三个亚型:EM、PM 和 EMlowPMlow神经胶质瘤。

  除了独特的基因组变异模式之外,EM神经胶质瘤与较高确诊年龄、不良预后,以及神经干细胞和星形胶质细胞生成(astrogenesis)基因较强表达相关。PM和EMlowPMlow神经胶质瘤则与较年轻的确诊年龄及较好的预后相关。PM神经胶质瘤丰富地表达少突胶质细胞发生(oligodendrogenesis)基因,而EMlowPMlow神经胶质瘤则富含成熟神经元和少突胶质细胞标记。

  这一基于EM/PM的分子分类法适用于成人低分级和高分级的弥漫性神经胶质瘤,优于现有的分类法可将将弥漫性神经胶质瘤分为具有不同转录组和基因组谱的亚型。这些EM/PM分类器中的大多数,包括神经胶质命运决定控制因子,都未曾在神经胶质瘤生物学中开展过广泛的研究。

  研究人员发现有一些分类器在小鼠神经胶质前体细胞中共表达,以一种EM/PM神经胶质瘤亚型特异性方式频繁扩增或丢失,导致体细胞拷贝数变异相关的基因表达,促成了神经胶质细胞瘤样本中的EM/PM标记。

  这一基于EM/PM的分子分类法未加速寻找新的神经胶质瘤八点提供了一个新的分子诊断框架。

相关文章

我国科研人员找到导致反复“试管”失败的“基因钥匙”

10月16日,记者从中信湘雅生殖与遗传专科医院获悉,该院研究员林戈、副研究员郑伟团队,联合山东大学、上海交通大学医学院等单位的科研团队开展合作攻关,系统揭示了卵子与早期胚胎质量问题导致女性反复“试管”......

我国研究团队牵头破解蒿属分类难题

由中国科学院植物研究所科研人员牵头的研究团队近日构建出覆盖最广的全球蒿属系统发育框架与完整的分类假说,破解了该领域百年研究仍缺乏全球蒿属系统发育框架与分类假说的难题。这项研究成果已在线发表于国际期刊《......

衰老如何改变我们的基因

衰老对身体产生的可见影响有时与基因活动的无形变化有关。DNA甲基化的表观遗传过程会随着年龄增长而变得不再精确,造成基因表达的变化。而这种变化与随着年龄增长而出现的器官功能衰退和疾病易感性增加有关。如今......

为何有人衰老更快?揭秘背后的400个基因

有些人比同龄人更显年轻,而有些人看着更显老;有些人年逾九旬仍身心康健,而另一些人早在数十年前就饱受糖尿病、阿尔茨海默病或行动障碍的困扰;有些人能轻松应对严重摔伤或流感侵袭,而有些人一旦住院就再难康复。......

科学家发现玉米耐热关键基因

近日,西北农林科技大学玉米生物学与遗传育种团队联合华中农业大学玉米团队在《植物生理学研究》发表论文。研究初步揭示了ZmGBF1-ZmATG8c模块通过自噬途径调控玉米耐热性的分子机制。随着全球气温持续......

降本提效!我团队研制出系列牛用基因芯片

记者21日从国家乳业技术创新中心获悉,该中心技术研发团队成功研制出奶牛种用胚胎基因组遗传评估芯片和“高产、抗病、长生产期”功能强化基因组预测芯片。该系列基因芯片具有完全自主知识产权,填补了我国基因芯片......

新研究:阻断或抑制一种特殊基因可选择性杀伤癌细胞

国际期刊《内分泌学前沿》日前刊登的一项新研究揭示,一种特殊基因对肠道吸收维生素D及其后续代谢过程至关重要,阻断或抑制该基因能够选择性抑制癌细胞生长。这一发现在癌症治疗等精准医学领域具有广阔应用前景。维......

我国科学家发现大豆种子油蛋比调控关键基因

记者从安徽农业大学获悉,该校王晓波教授团队联合中国农业科学院作物科学研究所邱丽娟、李英慧研究员团队,解析了关键基因对大豆种子油脂和蛋白比例(油蛋比)的调控机制,为高油或高蛋白大豆品种选育提供了新方向。......

茶叶大小谁定?这个基因很关键

茶树是以收获新梢为主的叶用经济作物,茶芽大小不仅直接影响鲜叶的产量和品质,还与茶类适制性密切相关。解析茶树芽大小的遗传调控机制,有助于改良茶树品种、提高茶叶产量。近日,中国农业科学院茶叶研究所种质资源......

这项研究找到了玉米穗叶结构候选基因

玉米作为全球重要的粮食、饲料和工业原料作物,其高产对保障粮食安全至关重要。近日,东北农业大玉米遗传育种团队完成的研究在《农业科学学报(英文)》(JournalofIntegrativeAgricult......