半纤维素酶在速溶咖啡生产中应用极广。常规法生产速溶咖啡是将咖啡豆提取液浓缩后直接进行冷冻干燥或喷雾干燥,由于咖啡豆中含有大量的半乳甘露聚糖,从而造成提取过程中粘度过大,给随后的浓缩和干燥带来困难。
使用甘露聚糖酶可以分解咖啡中的半乳甘露聚糖产生低聚糖,因此可大大降低咖啡的粘度,而粘度的降低可使生产中浓缩和干燥效率成倍提高,相应也就降低了速溶咖啡的生产成本。在谷物食品(主要是面包)上,半纤维素酶也体现了其独特的应用价值。面包食品的诸多特性在很大程度上受谷物面粉中戊聚糖和淀粉含量的影响,应用木聚糖酶可以水解谷物面粉中的木聚糖产生木寡糖,从而大大改善了面包的质地、结构和松软度。