HapMap还将产生截止2013年尚很难预料的知识上的进展。未来可以在患者的遗传构成的基础上实现个体化医疗,从而得到最好的效果并将副作用降至最低。与长寿和抗病能力有关的遗传变异将被确定,从而产生具有广泛益处的新疗法。对任何新知识而言,HapMap既带来新的挑战,又带来不可预料的空前的机遇。